Três íons de sódio (Na+) presentes no citosol ligam-se a sítios específicos na ATPase. Na subunidade maior liga-se também o ATP que por fosforilação altera a conformação da proteína transportadora, liberando ADP e movimentando os íons Na+ para o meio externo. Dois íons de potássio (K+) presentes no meio extracelular ligam-se a sítios de alta afinidade na ATPase. A desfosforilação reduz a afinidade dos íons K+ e estes são liberados no citosol.